1. Установить portdowngrade.
2. Изучить диаграмму с утилитами.
3. Собрать пакет для одного из портов, например nginx, htop, mtr (можно свой вариант).
4**. Обновить систему из портов (portmaster или portupgrae) и разобраться с возникшими ошибками обновления (если будут)